Το Πανεπιστήμιο Αιγαίου είναι είναι δημόσιο Ανώτατο εκπαιδευτικό Ίδρυμα. Η πολυνησιωτικότητα και η εισαγωγή νεωτερικών αντικειμένων είναι τα κυρίαρχα γνωρίσματα από την ίδρυσή του, τον Μάρτιο του 1984, μέχρι σήμερα.
Τμήματά του βρίσκονται σε έξι (6) νησιά. Έχει παρουσία στους πέντε Νομούς του Αιγαίου και αποτελεί το μόνο Ελληνικό Πανεπιστήμιο με Τμήματα σε δύο Περιφέρειες της Χώρας.
Ακαδημαϊκά συγκροτείται από 18 Τμήματα υπαγόμενα σε 6 Σχολές. Παρέχει 18 Προγράμματα Προπτυχιακών Σπουδών ενώ ξεπερνούν τις 60 οι κατευθύνσεις Μεταπτυχιακών Σπουδών. Επιπλέον, προσφέρεται η δυνατότητα εκπόνησης Διδακτορικής Διατριβής στα 18 Τμήματα του Ιδρύματος. Νέες μορφές εκπαίδευσης στις οποίες το Πανεπιστήμιο Αιγαίου αναπτύσσει σημαντική δραστηριότητα, αφορούν στα Προγράμματα «Εξ Αποστάσεως Δια Βίου Μάθησης» και στα Προγράμματα «Θερινών Σχολείων».
Η αποστολή του Πανεπιστημίου Αιγαίου, ενός δημοσίου Πανεπιστημίου στην Ελλάδα, προσδιορίζεται από τρεις άξονες:
Εκπαίδευση:
Παρέχεται εκπαίδευση σε τρεις κύκλους:
1ος κύκλος σπουδών, βασικές σπουδές, Πτυχίο ή Δίπλωμα πενταετούς φοίτησης,
2ος κύκλος σπουδών, Μεταπτυχιακές Σπουδές, Μεταπτυχιακό Δίπλωμα (MSc),
3ος κύκλος, Διδακτορικές Σπουδές, Διδακτορικό Δίπλωμα (PhD).
Πέραν από τους τρεις αυτούς θεσμικούς κύκλους εκπαίδευσης, παρέχονται επιπρόσθετα Προγράμματα επιστημονικής, διεπιστημονικής και επαγγελματικής εξειδίκευσης, όπως Προγράμματα που ενισχύουν την εκπαίδευση των νέων Ερευνητών (Διεθνή Θερινά Σχολεία), Προγράμματα Επιμόρφωσης και Διά Βίου Μάθησης κ.α., προκειμένου να καλύπτονται διαρκώς οι ανάγκες της επιστήμης και της κοινωνίας.